транспортные услуги

Простите, а можно я Вас более подробно поспрашиваю?
Где у Вас прописка? С кем хотите работать в основном по перевозкам - с одной компанией, с разными юридическими лицами, с гражданами? По России, за рубеж? Счет хотите открывать? Будет ли у Вас наемный водитель?
Все в комментарий. Потому что в 2013 году есть варианты, их и надо рассмотреть исходя из разных условий.

Давайте начнем с самого начала.
До 31 декабря 2012 года ЕНВД являлся обязательным, даже можно скзатаь - принудительным налоговым режимом. На территории (в городе, в районе), где вводился ЕНВД на определенные виды деятельности, он был абсолютно обязателен к применению.
Следовательно, если до 31 декабря 2012 года Вы занимались грузоперевозками там, где был введен ЕНВД на данный вид деятельности, независимо от Вашего заявления на применение упрощенки по данному виду деятельности упрощенку Вы не могли применять. Вообще. Вы могли применять только ЕНВД и ничего другого.